Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l2Q6KAU8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms