Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9aQ68FE2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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