Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd180Q62192 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd180Q62192 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms