Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcd1Q61466 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcd1Q61466 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd1Q61466 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms