Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap44Q5SSM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap44Q5SSM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms