Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc1Q5NCF2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms