Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Shank3Q4ACU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Shank3Q4ACU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms