Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk3Q3U3Q1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk3Q3U3Q1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms