Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy4Q3TYX8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy4Q3TYX8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms