Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpd4Q3TT99 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd4Q3TT99 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms