Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V1rd19Q3KNP5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
V1rd19Q3KNP5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms