Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr16c6Q05A13 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms