Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms