Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx2P97474 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms