Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Abcc9P70170 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Abcc9P70170 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc9P70170 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Abcc9P70170 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Abcc9P70170 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc9P70170 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC43.34■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 923.6 ms