Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sumo1P63166 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo1P63166 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms