Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Barhl1P63157 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Barhl1P63157 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barhl1P63157 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms