Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps11P62281 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps11P62281 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms