Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgd1P52734 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms