Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmod1P49813 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmod1P49813 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms