Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ercc3P49135 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms