Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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