Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TfamP40630 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TfamP40630 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TfamP40630 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TfamP40630 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TfamP40630 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TfamP40630 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TfamP40630 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TfamP40630 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TfamP40630 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TfamP40630 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TfamP40630 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TfamP40630 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TfamP40630 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TfamP40630 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TfamP40630 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms