Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk2P38575 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk2P38575 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk2P38575 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk2P38575 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk2P38575 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk2P38575 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms