Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab21P35282 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rab21P35282 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab21P35282 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab21P35282 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms