Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnd1P30999 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms