Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msr1P30204 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msr1P30204 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msr1P30204 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msr1P30204 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msr1P30204 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms