Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afxP27661 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afxP27661 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2afxP27661 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afxP27661 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afxP27661 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms