Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtmaP26350 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtmaP26350 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtmaP26350 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtmaP26350 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtmaP26350 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtmaP26350 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtmaP26350 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms