Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3P21107 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms