Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01736 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01736 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01736 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01736 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01736 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01736 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01736 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01736 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01736 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01736 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01736 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01736 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01736 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01736 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01736 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01736 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01736 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01736 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms