Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp9O88851 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp9O88851 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms