Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f3O35261 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f3O35261 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms