Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr3O09116 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms