Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r68E9Q0V3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms