Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms