Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm4491E0CX42 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm4491E0CX42 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm4491E0CX42 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm4491E0CX42 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm4491E0CX42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm4491E0CX42 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm4491E0CX42 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm4491E0CX42 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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