Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12cD3Z3L3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12cD3Z3L3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12cD3Z3L3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms