Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmed7D3YZZ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed7D3YZZ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms