Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms