Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700016G14RikA0A286YCZ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms