Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H8

Igkv1-133, Immunoglobulin kappa variable 1-133 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms