Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsc22d3Q9Z2S7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms