Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rspo1Q9Z132 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rspo1Q9Z132 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms