Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NgfrQ9Z0W1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NgfrQ9Z0W1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms