Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl3Q9WVL6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl3Q9WVL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl3Q9WVL6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms