Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited4Q9WUL8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited4Q9WUL8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms