Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndrg3Q9QYF9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms