Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem239Q9DA47 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem239Q9DA47 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem239Q9DA47 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms