Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tspan17Q9D7W4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan17Q9D7W4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan17Q9D7W4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan17Q9D7W4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms